Обитает этот вид в холодных горных ручьях на высоте от 180 до 1350 метров над уровнем моря, и воду покидает крайне редко.
Гигантская японская саламандра вырастает в длину до полутора метров с учетом длинного широкого хвоста, и может весить до 25 кг. Все ее тело покрыто серой, черно или зеленой морщинистой кожей с небольшими бородавчатыми наростами — они увеличивают площадь поверхности кожного покрова, именно через кожу саламандра дышит. У нее также есть легкие, но они рудиментарные и не участвуют в процессе дыхания. Глаза у животного маленькие, а зрение у него развито крайне слабо.
Благодаря медленно протекающим процессам метаболизма в организме, японская исполинская саламандра может обходиться без питания несколько недель. От других родственных видов она отличается наличием жаберных отверстий.
Период размножения приходится на начало осени. В это время животные собираются в места гнездования, которые представляют собой скалистые пещеры или ямы под водой. Самцы весьма агрессивно конкурируют, чтобы занять место в этих полостях.
Самки откладывают яйца (их количество достигает 400 – 500 штук) прямо в углубления, самец тут же их оплодотворяет. Все дальнейшие заботы о потомстве ложатся на плечи самца: он защищает яйца от сородичей и хищников около 12-15 недель, пока из них не вылупятся молодые саламандры. Как и другие амфибии, она проходит три стадии развития: яйцо, личинка, взрослая особь. Японская саламандра растет непрерывно в течении всей жизни. Возраст половой зрелости доподлинно не известен, но, учитывая конкуренцию у самцов, вполне вероятно, что они должны достичь весьма крупных размеров.
Японская саламандра ведет ночной образ жизни, днем, как правило, спит в укромных местах. Передвигаются животные бродя по дну на своих лапах, а при необходимости резкого ускорения на короткое расстояние подключают еще и хвост. Двигается саламандра обычно против течения, что обеспечивает лучшее дыхание.
Гигантская японская саламандра является территориальным животным, и часто мелкие самцы погибают от «лап» их более крупных собратьев. В качестве средства предупреждения земноводное выделяет секрет с характерным запахом, которое на открытом воздухе быстро достигает студенистой консистенции.
Японская саламандра является плотоядным существом. Свою добычу она ловит резко и широко открывая пасть, из-за чего создается разность давлений, и жертва вместе с потоком воды отправляется в желудок. Так как ест это земноводное в воде, то в слюне оно абсолютно не нуждается.
Врагов у исполинской саламандры немного, и главным среди них является человек, отлавливающий животных как ради мяса, так и ради некоторых частей тела, используемых в народной медицине. От других врагом саламандра успешно скрывается посредством маскировки.